นาโนฮะAUนี้ได้ปฏิบัติภารกิจลับสุดยอดที่ต้องปิดบังเฟท…และทำในสิ่งที่นาโนฮะในจักรวาลหลักไม่มีวันทำ // ยิ้มชั่วร้ายก่อนกางแขนเหมือนเปิดม่านการแสดง // เอาล่ะ มาดูความมืดของปีศาจสีขาวผู้อาบไปด้วยเลือดกันเถอะ ดาร์กคาสึ

ทักษะพิเศษ “Innate Gift” ที่มีเพียงไม่กี่คนเท่านั้นที่รู้จักกันในชื่อ “IG”. ความสามารถที่หายากดังกล่าวถูกรวบรวมที่โรงเรียนชั้นยอดในโตเกียว. ครูประจําชั้นเป็นหุ่นยนต์ที่แข็งแกร่งที่สุด Mr. Kitamura! มีเสียงดังและเต็มไปด้วยฟังก์ชั่นแปลก ๆ… ฉันไม่เคยเห็นครูแบบนี้มาก่อน!! เขาต้องการใช้ชีวิตในโรงเรียนมัธยมอย่างสงบสุข แต่… วันที่น่าเบื่อถูกทําลาย! หนังแอ็คชั่นของโรงเรียนสําหรับเด็กที่มีความสามารถแตกต่างกัน!!

วันดีคืนดี ก็มีฝูงหน้ากากบินผ่านเมืองมา แล้วในไม่ช้าก็เกิดคดีปริศนาขึ้น